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アイテム
個人の組織から分離された繊維芽細胞及びそれらから作成されたiPS細胞のエピジェネティッククロック解析
https://nagoya-wu.repo.nii.ac.jp/records/4313
https://nagoya-wu.repo.nii.ac.jp/records/43130652ca58-a542-495f-83a4-d1952e0112dd
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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kojinkasei65_27-38 (518.1 kB)
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.png)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2019-10-10 | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | 個人の組織から分離された繊維芽細胞及びそれらから作成されたiPS細胞のエピジェネティッククロック解析 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Epigenetic Clock Analysis of Fibroblasts Prepared From a Single Donor and iPS Cells Derived from the Fibroblasts | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||||||||
| 著者 |
堀江, 信之
× 堀江, 信之
× 高橋, 和利
× 加治, 和彦
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | We performed Epigenetic Clock（EC） analysis of ASF-4 cells, which were derived from a single donor at different ages over 30 years. Optimization using a function of MethylAger software was performed and we demonstrated that it is possible to estimate the ages from methylation sites for both ASF-4 cells and iPS cells prepared from ASF-4 cells. For ASF-4 cells, iPS cells, and all the cells, we were able to select three to eight methylation sites, from which the donor ages were estimated with a root mean squared error of fewer than 6 years. Methylation sites obtained by analysis of EC tend to exist in the vicinity of genes, and these genes contained genes related to aging that have been reported so far. Since it was possible to estimate age not only for fibroblasts but also for iPS cells derived from them, it is suggested that some age-dependent methylation sites exist even in the iPS cells. It is also suggested that analysis of the epigenetic clock is valuable as a method to identify genes related to aging involving DNA methylation. | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | 本研究では，30年以上にわたり，単一のドナーから調製された線維芽細胞であるASF-4細胞を用いてエピジェネティッククロック（EC）解析を行った．Bioconductorに登録されているDNAメチル化解析用のソフトウェア，MethylAger（RnBeads）の機能を用いて最適化を行い，ASF-4細胞，およびASF-4細胞より調製されたiPS細胞の両方でDNAメチル化部位からの年齢の推定が可能であることを示した．さらに，ASF-4細胞，それから作成したiPS細胞，および全細胞について，それぞれ３から８か所のメチル化部位を用いて，６年未満の誤差（RMS誤差:RMSE）での年齢推定が可能であった．EC解析により得られたメチル化部位は，遺伝子の近傍に存在する傾向があり，それらの遺伝子には，これまでに老化との関連が報告されているものが含まれていた．線維芽細胞だけではなく，iPS細胞についても年齢推定が可能であったことから，iPS細胞においても，一部の年齢依存性を示すメチル化部位が存在していることが示唆された．また，EC解析により選ばれたメチル化部位が，老化関連遺伝子の近傍にある例が見いだされることから，EC解析は，DNAメチル化を伴う加齢に関連する遺伝子を同定する方法としても有効であることが示唆された． | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
ja : 名古屋女子大学紀要. 家政・自然編, 人文・社会編 en : Journal of Nagoya Women's University. Home economics・natural science humanities・social science 号 65, p. 27-38, 発行日 2019-03 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | 名古屋女子大学 | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Nagoya Women's University | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 21857962 | |||||||||||||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12530109 | |||||||||||||||||||||||
